Mongozo begon met Henrique Kabia, die in 1993 als vluchteling uit Angola naar Nederland kwam en een oud familierecept voor palmnotenbier meenam. Samen met Jan Fleurkens bracht hij dat bier vanaf 1998 op de markt onder de naam Mongozo, wat 'proost' betekent in de taal van het Chokwe-volk uit Angola, Congo en Zambia. Na het overlijden van Kabia in 2003 zette Fleurkens het merk voort met nieuwe recepten. De bieren worden gebrouwen bij Brouwerij Huyghe in het Oost-Vlaamse Melle, de brouwerij achter Delirium, die het merk sinds 2009 ook in handen heeft.
Het merk draait om exotische ingrediënten met een fairtradekeurmerk, zoals banaan (2001), kokos (2005) en mango (2008). In 2010 kwam daar de Mongozo Premium Pilsener bij, volgens het merk de eerste pils ter wereld die tegelijk biologisch, glutenvrij en fairtrade is. Er gaat gewoon gerstemout in, maar tijdens het brouwen worden de gluten afgebroken; de rijst in het recept is fairtrade. De pils won meerdere prijzen, waaronder de titel beste glutenvrije pils bij de eerste World Gluten Free Beer Awards in 2013.